Si te pones a usar una aplicación hecha con Qt, o a través de Wine, etc. y ves que los acentos no salen bién, puede que tengas un problema en el método de entrada (input method) que usas. Solución: Abre im-chooser. Selecciona el método IBus. Si te pregunta si quieres arrancar el demonio IBus, dí que sí. Reinicia la sesión.