Desde que uso Gnome 3.4 no veo un pimiento en la terminal empotrada de Gedit, porque aplica su propia paleta de colores, poniendo el texto en blanco y el fondo en gris suave. Para corregirlo: $ gsettings set org.gnome.gedit.plugins.terminal foreground-color "#FFFFFF" Así se ponen las letras en negro. Puedes usar cualquier color en RGB hexadecimal. Editado: Gracias al comentario de Sir Co$t Granda (@costesito), hemos visto la luz.